什么是全血基因組DNA提取?利用明膠的吸附作用,使紅細胞沉降在管底與白細胞分離。通過SDS的破膜作用,使白細胞釋放出DNA,然后利用酚和氯仿抽提純化,分離除去蛋白質,后用乙醇沉淀吸出DNA。*采用可以特異性結合DNA的離心吸附柱和*的緩沖液系統(tǒng),提取全血基因組DNA。 離心吸附柱中采用的硅基質材料為本公司*新型材料,能夠、專一吸附DNA,可大限度去除雜質蛋白及細胞中其他有機化合物。
*的操作步驟
1、樣品的處理(本產品適用于處理新鮮的或已經(jīng)添加抗凝劑的0.lml-1ml血液樣品):
a、在血液樣品中加入2-3倍體積的紅細胞裂解液,充分顛倒混勻,12000rpm離心1min,小心吸去上清,沉淀應為白色或淡紅色,如果裂解不*,可重復以上述步驟一次。向沉淀中加200ul溶液YA,振蕩至*混勻。
b、 如果處理的血樣為禽類、鳥類、兩棲類或更低級生物的血液,其紅細胞為有核細胞,因此處理量為5-20u1,不需要再用紅細胞裂解液處理,直接加200ul溶液YA,振蕩至*混勻。
2、向懸浮液中加入20ul 的RNase A (10mg/ml),充分顛倒混勻,室溫放置10min。
3、加入20ul的蛋白酶K( 10mg /ml ),充分顛倒混勻,65℃水浴消化30-60min,消化期間可顛倒離心管混勻數(shù)次,直至樣品消化*為止。
4、加入200ul溶液YB,再加入200ul無水乙醇,充分顛倒混勻,此時可能會出現(xiàn)絮狀沉淀,不影響DNA的提取,可將溶液和絮狀沉淀都加入吸附柱中,室溫放置2min。
5、12000rpm離心2min,棄廢液,將吸附柱放入收集管中。
6、向吸附柱中加入600ul漂洗液(使用前請先檢查是否已加入無水乙醇),12000rpm離心1min,棄廢液,將吸附柱放入收集管中。
7、向吸附柱中加入600ul漂洗液,12000rpm離心1min,棄廢液,將吸附柱放入收集管中。
8、12000rpm離心2min,將吸附柱敞口置于室溫或50℃溫箱放置數(shù)分鐘,目的是將吸附柱中殘余的漂洗液去除,否則漂洗液中的乙醇會影響后續(xù)的實驗如酶切、PCR等。
9、將吸附柱放入一個干凈的離心管中,向吸附膜*懸空滴加50-200ul經(jīng)65℃水浴預熱的洗脫液,室溫放置5min,12000rpm離心1min。
10、離心所得洗脫液可再加入吸附柱中,12000rpm離心2min,即可得到高質量的基因組DNA。
使用*注意事項
1、本試劑盒置于室溫( 15 -25℃) 干燥條件下可保存12個月,更長時間的保存可置于2 -8℃。
2、常用的血液抗凝劑有EDTA、ACD和肝素等,需注意的是,如欲制備大分子量血液基因組DNA,可優(yōu)先考慮使用ACD抗凝。一般不使用肝素抗凝,因為用肝素抗凝的血液提取的基因組DNA進行PCR擴增時,有PCR擴增抑制現(xiàn)象。
3、樣品應避免反復凍融,否則會導致提取的DNA片段較小且提取量也下降。
4、如果試劑盒中的溶液出現(xiàn)沉淀,可在65℃水浴中重新溶解后再使用,不影響效果。
5、絕大多數(shù)哺乳動物全血中的紅細胞無核,故在提取基因組DNA時需去除不含DNA的無核紅細胞,以免影響白細胞裂解和DNA釋放。如果處理的血樣為禽類、鳥類、兩棲類或更低級生物的血液,其紅細胞為有核細胞,因此處理量減少為5-20ul,不需要再用紅細胞裂解液來裂解紅細胞。
6、洗脫緩沖液的體積hao不少于50ul,體積過小會影響回收效率:洗脫液的pH值對洗脫效率也有影響;若需要用水做洗脫液應保證其pH值在8.0左右(可用NaOH將水的pH值調至此范圍),pH 值低于7.0會降低洗脫效率。