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新報道:“合成腸道菌群”第1步

時間:2018-11-5閱讀:209
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       哈佛大學Wyss研究所和哈佛 醫(yī)學院的研究人員設(shè)計出了一種遺傳信號傳輸系統(tǒng),小鼠體內(nèi)實驗證明,傷*(Salmonella Typhimurium)對環(huán)境線索的反應可被腸道中的大腸桿菌接收,該模型使科學家們距離“合成微生物”(攜帶特定功能的編程細菌)更近一步。文章發(fā)表于《ACS Synthetic Biology》。


       有記錄的人類腸道細菌超過1000種,腸道微生物菌群對人體健康和疾病的影響是目前的學術(shù)研究熱點。

         有關(guān)腸道細菌之間如何相互通信,以及它們之間是否存在所謂的信號通路?人們還知之甚少。

         哈佛大學Wyss研究所和哈佛 醫(yī)學院的研究人員設(shè)計出了一種遺傳信號傳輸系統(tǒng),小鼠體內(nèi)實驗證明,傷*(Salmonella Typhimurium)對環(huán)境線索的反應可被腸道中的大腸桿菌接收,該模型使科學家們距離“合成微生物”(攜帶特定功能的編程細菌)更近一步。文章發(fā)表于《ACS Synthetic Biology》。

   

       “為了通過工程細菌改善人類健康,我們首先需要弄清楚細菌如何進行交流,”Wyss研究所Pamela Silver實驗室的研究生、文章一作Suhyun Kim說。“我們想確保我們始終有辦法控制和協(xié)調(diào)工程微生物。”

       于是,研究小組準備利用細菌的“群體感應(quorum sensing)”效應。在哺乳動物腸道中,有一類特別的群體感應,名為?;?內(nèi)酯(acyl-homoserine lactone,HSL)感知,研究小組決定看看他們是否可以重新利用這個信號系統(tǒng),采用基因工程創(chuàng)建細菌信息傳遞系統(tǒng)。

        研究人員將兩個新基因電路引入大腸桿菌的不同菌落:信號轉(zhuǎn)導電路和“應答器”電路。信號轉(zhuǎn)導電路包括1個luxl基因拷貝,該基因受脫水四環(huán)素(anhydrotetracycline,ATC)開啟,并產(chǎn)生一個群體感應信號分子。應答器電路被設(shè)計成當信號分子與之結(jié)合,cro基因就會被激活表達Cro蛋白,隨之開啟應答器電路內(nèi)的“記憶元件”。記憶元件表達另外兩個基因:LacZ和另一個拷貝的cro,LacZ使細菌在藍白斑篩選瓊脂培養(yǎng)基上變藍,而多余拷貝的cro形成一個正反饋,使記憶元件保持開啟,確保細菌長時間表達LacZ。

        研究人員證實,體外實驗中,該系統(tǒng)對大腸桿菌和鼠傷*都有效——加入ATC,應答細菌變藍。為了觀察它們在體內(nèi)是否奏效,研究人員給小鼠注射信號轉(zhuǎn)導菌和應答菌,然后在小鼠飲用水中加入ATC,分析小鼠分辨樣本,超過一半的小鼠顯示出HSL信號傳遞跡象,效果可在ATC給藥后繼續(xù)保持2天。

      “這個基于單拷貝的電路在小鼠內(nèi)臟中創(chuàng)建了功能性通信,”Kim解釋說。“傳統(tǒng)的基因工程通過質(zhì)粒將感興趣的基因多拷貝引入細菌基因組,這個工程細菌帶來了高代謝負擔,使它們很容易被宿主菌群淘汰。”

        后,研究小組讓沙門氏菌作為轉(zhuǎn)導細菌,讓大腸桿菌充當應答細菌,重復小鼠體內(nèi)實驗證實該電路允許跨不同細菌種類在哺乳動物復雜的腸道環(huán)境中進行通信。

       “我們的終目標是創(chuàng)建覆蓋完整或大部分人類腸道菌群的工程細菌,其中每一種都具有特殊功能(例如診斷、治療、生產(chǎn)有益分子、改善消化等),它們能與其他細菌交流,彼此融洽合作改善人類健康,”文章通訊作者Silver教授說道。

      “微生物組防治微生物感染的生態(tài)學方法(microbiome)是醫(yī)學和健康研究的下一個前沿領(lǐng)域,”Wyss研究所創(chuàng)始主任Donald Ingber博士說。“設(shè)計新技術(shù)使腸道微生物變得更好,同時認識到它們作為復雜群落的一部分來發(fā)揮作用,我們正朝向這個目標大步前進。”

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