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- 公司名稱 上海達(dá)為科生物科技有限公司
- 品牌
- 型號
- 所在地 上海市
- 廠商性質(zhì) 生產(chǎn)廠家
- 更新時間 2020/4/3 16:22:42
- 訪問次數(shù) 777
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全基因組甲基化測序 的詳細(xì)介紹
一、服務(wù)介紹
DNA甲基化是重要的表觀遺傳學(xué)標(biāo)記信息,獲得全基因組范圍內(nèi)所有C位點的甲基化水平數(shù)據(jù),對于表觀遺傳學(xué)的時空特異性研究具有重要意義。我們以新一代高通量測序平臺為基礎(chǔ),結(jié)合全基因組Bisulfite處理和生物信息數(shù)據(jù)分析技術(shù),進(jìn)行低成本、高效率、高準(zhǔn)確度的全基因組DNA甲基化水平圖譜繪制。特定物種的高度甲基化修飾模式的分析,必將在表觀基因組學(xué)研究中
全基因組甲基化測序 的詳細(xì)介紹
一、服務(wù)介紹
DNA甲基化是重要的表觀遺傳學(xué)標(biāo)記信息,獲得全基因組范圍內(nèi)所有C位點的甲基化水平數(shù)據(jù),對于表觀遺傳學(xué)的時空特異性研究具有重要意義。我們以新一代高通量測序平臺為基礎(chǔ),結(jié)合全基因組Bisulfite處理和生物信息數(shù)據(jù)分析技術(shù),進(jìn)行低成本、高效率、高準(zhǔn)確度的全基因組DNA甲基化水平圖譜繪制。特定物種的高度甲基化修飾模式的分析,必將在表觀基因組學(xué)研究中具有里程碑式的意義,并為細(xì)胞分化、組織發(fā)育等基礎(chǔ)機(jī)制研究,以及動植物育種、人類健康與**研究奠定基礎(chǔ)。
二、分析項目
標(biāo)準(zhǔn)分析項目
1) 數(shù)據(jù)過濾(去除adaptor,低質(zhì)量的reads等)
2) 序列比對、覆蓋度統(tǒng)計、測序深度統(tǒng)計
3) SNP/InDel/CNV/SV變異信息檢測
4) SNP/InDel/CNV/SV多種數(shù)據(jù)庫注釋
上等分析項目
1)腫瘤:
體細(xì)胞突變位點篩選;
基于質(zhì)譜的 case/control 樣品成對初步鑒定
成對樣品的Somatic SNV/InDel/CNV檢測、注釋及統(tǒng)計
成對樣品SNV/InDel的COSMIC 數(shù)據(jù)庫注釋分析
成對樣品SNV的保守型預(yù)測
成對樣品SV檢測分析(CREST)及注釋
影響氨基酸改變的突變基因的 CancerGeneCensus 數(shù)據(jù)庫注釋分析
2)復(fù)雜**研究
樣本設(shè)計以及power計算
群體SNP 檢測和Genotype 分型檢測
SNP注釋與統(tǒng)計
群體SNP 質(zhì)控
基于遺傳數(shù)據(jù)的樣本質(zhì)控
基于單個SNP的關(guān)聯(lián)分析
重要結(jié)論的獲得。
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