NIST RM 8461人肝臟用于蛋白質(zhì)組學(xué)標(biāo)準(zhǔn)品旨在支持復(fù)雜樣品中肽和蛋白質(zhì)鑒定的研究，例如基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)中的那些。 RM 8461 可用于幫助評(píng)估實(shí)驗(yàn)室內(nèi)肽和蛋白質(zhì)鑒定的可信度或?qū)嶒?yàn)室之間或不同測(cè)量方法之間的可比性。 RM 8461 還可用于開(kāi)發(fā)和驗(yàn)證用于識(shí)別肽和蛋白質(zhì)的新研究方法。一個(gè) RM 8461 單元由一個(gè)裝有約 0.5 克凍干人肝材料的小瓶組成。
儲(chǔ)存：
RM 8461 應(yīng)儲(chǔ)存在受控的室溫（20 °C 至 25 °C）下，避免陽(yáng)光直射，直至需要。
使用：
NIST RM 8461人肝臟用于蛋白質(zhì)組學(xué)標(biāo)準(zhǔn)品在取出測(cè)試部分進(jìn)行分析之前，應(yīng)*混合內(nèi)容物。建議使用等于或大于 1 mg 的分析測(cè)試部分。
分析：
對(duì)于蛋白質(zhì)特性等定性測(cè)量，不能使用符合 JCGM GUM 的測(cè)量不確定度的常規(guī)評(píng)估和表達(dá)。表 1 列出了使用鑒定算法建立的 1619 種蛋白質(zhì)的身份，其可靠性得到該領(lǐng)域?qū)＜业钠毡檎J(rèn)可。 RM 8461 中鑒定的蛋白質(zhì)是使用多個(gè)搜索引擎和多種樣品制備方法從自下而上的蛋白質(zhì)組學(xué)分析中推斷出來(lái)的。從 8 罐 RM 8461 的單個(gè) 1 mg 制劑 (n = 3) 中過(guò)濾出常見(jiàn)的蛋白質(zhì)，并重復(fù)注射 (n = 3)。僅當(dāng)滿足以下條件時(shí)才包含蛋白質(zhì)：
• 錯(cuò)誤發(fā)現(xiàn)率 (FDR) 低于 5 %，
• 整個(gè)測(cè)量組的光譜豐度優(yōu)于 20% CV（包括技術(shù)和工藝重復(fù)分析），
• 在RM 8461 的整個(gè)生產(chǎn)過(guò)程中，使用Sequest HT、Mascot、MSAmanda 和Byonic 算法從八個(gè)罐子的分層隨機(jī)抽樣中鑒定出至少三種*的肽。
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